Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCARF1Q14162 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCARF1Q14162 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
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