Protein–RNA interactions for Protein: Q14019

COTL1, Coactosin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COTL1Q14019 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
COTL1Q14019 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COTL1Q14019 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COTL1Q14019 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COTL1Q14019 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COTL1Q14019 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COTL1Q14019 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COTL1Q14019 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COTL1Q14019 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COTL1Q14019 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COTL1Q14019 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
COTL1Q14019 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COTL1Q14019 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COTL1Q14019 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COTL1Q14019 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COTL1Q14019 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COTL1Q14019 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COTL1Q14019 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COTL1Q14019 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COTL1Q14019 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COTL1Q14019 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COTL1Q14019 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COTL1Q14019 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COTL1Q14019 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms