Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CDK13Q14004 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CDK13Q14004 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CDK13Q14004 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
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