Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA9Q13797 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA9Q13797 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms