Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HTR4Q13639 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HTR4Q13639 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms