Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
PTCH1Q13635 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTCH1Q13635 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
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