Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDH18Q13634 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDH18Q13634 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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