Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IRF5Q13568 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
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