Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
MTM1Q13496 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MTM1Q13496 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms