Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD2Q13200 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD2Q13200 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD2Q13200 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD2Q13200 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSMD2Q13200 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD2Q13200 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms