Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAF1Q13077 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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TRAF1Q13077 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAF1Q13077 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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