Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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GTF3C1Q12789 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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GTF3C1Q12789 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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GTF3C1Q12789 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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GTF3C1Q12789 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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GTF3C1Q12789 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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GTF3C1Q12789 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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GTF3C1Q12789 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3C1Q12789 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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GTF3C1Q12789 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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GTF3C1Q12789 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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GTF3C1Q12789 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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GTF3C1Q12789 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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GTF3C1Q12789 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GTF3C1Q12789 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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