Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC35.66■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
HMGXB3Q12766 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
HMGXB3Q12766 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
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