Protein–RNA interactions for Protein: Q12516

SRF1, Regulator of phospholipase D SRF1, yeastyeast

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRF1Q12516 TUS1YLR425W 3924 nt2.91□□□□□ -1.94
SRF1Q12516 BMS1YPL217C 3552 nt2.91□□□□□ -1.94
SRF1Q12516 YSP2YDR326C 4317 nt2.91□□□□□ -1.94
SRF1Q12516 APL2YKL135C 2181 nt2.91□□□□□ -1.94
SRF1Q12516 FYV10YIL097W 1551 nt2.91□□□□□ -1.94
SRF1Q12516 MLH1YMR167W 2310 nt2.9□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 AMS1YGL156W 3252 nt2.9□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 MMS1YPR164W 4224 nt2.9□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 RPS22AYJL190C 393 nt2.9□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt2.9□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt2.9□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt2.9□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 EAF1YDR359C 2949 nt2.9□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 INP51YIL002C 2841 nt2.9□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 ACB1YGR037C 264 nt2.89□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 YLL020CYLL020C 306 nt2.89□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.89□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 YBT1YLL048C 4986 nt2.89□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 RPN1YHR027C 2982 nt2.88□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.88□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 GEA1YJR031C 4227 nt2.88□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 PHO91YNR013C 2685 nt2.88□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 BCK1YJL095W 4437 nt2.87□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 PMR1YGL167C 2853 nt2.86□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 DGR2YKL121W 2559 nt2.86□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 SMC6YLR383W 3345 nt2.86□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 CDC53YDL132W 2448 nt2.86□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt2.86□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 VMR1YHL035C 4779 nt2.86□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 ALK1YGL021W 2283 nt2.86□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 YGR067CYGR067C 2415 nt2.85□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 TRS130YMR218C 3309 nt2.85□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 SAS3YBL052C 2496 nt2.84□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 BFR2YDR299W 1605 nt2.84□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 SNQ2YDR011W 4506 nt2.84□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 RPS29AYLR388W 171 nt2.84□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 NOP14YDL148C 2433 nt2.84□□□□□ -1.95
SRF1Q12516 BIR1YJR089W 2865 nt2.84□□□□□ -1.96
SRF1Q12516 APL1YJR005W 2103 nt2.83□□□□□ -1.96
SRF1Q12516 GLG1YKR058W 1851 nt2.82□□□□□ -1.96
SRF1Q12516 TAO3YIL129C 7131 nt2.82□□□□□ -1.96
SRF1Q12516 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.82□□□□□ -1.96
SRF1Q12516 KAP120YPL125W 3099 nt2.82□□□□□ -1.96
SRF1Q12516 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.82□□□□□ -1.96
SRF1Q12516 CBF2YGR140W 2871 nt2.82□□□□□ -1.96
SRF1Q12516 SEC26YDR238C 2922 nt2.82□□□□□ -1.96
SRF1Q12516 TOP2YNL088W 4287 nt2.82□□□□□ -1.96
SRF1Q12516 COX5BYIL111W 456 nt2.81□□□□□ -1.96
SRF1Q12516 SAP1YER047C 2694 nt2.81□□□□□ -1.96
SRF1Q12516 FAR11YNL127W 2862 nt2.81□□□□□ -1.96
SRF1Q12516 BPT1YLL015W 4680 nt2.8□□□□□ -1.96
SRF1Q12516 ISW1YBR245C 3390 nt2.8□□□□□ -1.96
SRF1Q12516 MRD1YPR112C 2664 nt2.8□□□□□ -1.96
SRF1Q12516 SGM1YJR134C 2124 nt2.8□□□□□ -1.96
SRF1Q12516 SAP190YKR028W 3102 nt2.79□□□□□ -1.96
SRF1Q12516 SWR1YDR334W 4545 nt2.79□□□□□ -1.96
SRF1Q12516 SCD5YOR329C 2619 nt2.79□□□□□ -1.96
SRF1Q12516 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.78□□□□□ -1.96
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SRF1Q12516 RPL37BYDR500C 267 nt2.78□□□□□ -1.96
SRF1Q12516 RPS26AYGL189C 360 nt2.78□□□□□ -1.96
SRF1Q12516 JSN1YJR091C 3276 nt2.78□□□□□ -1.97
SRF1Q12516 POL5YEL055C 3069 nt2.77□□□□□ -1.97
SRF1Q12516 SEC1YDR164C 2175 nt2.77□□□□□ -1.97
SRF1Q12516 PDR1YGL013C 3207 nt2.76□□□□□ -1.97
SRF1Q12516 RTT107YHR154W 3213 nt2.76□□□□□ -1.97
SRF1Q12516 VPS8YAL002W 3825 nt2.76□□□□□ -1.97
SRF1Q12516 PDR11YIL013C 4236 nt2.76□□□□□ -1.97
SRF1Q12516 PRP8YHR165C 7242 nt2.75□□□□□ -1.97
SRF1Q12516 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt2.74□□□□□ -1.97
SRF1Q12516 KRE33YNL132W 3171 nt2.74□□□□□ -1.97
SRF1Q12516 TAH1YCR060W 336 nt2.73□□□□□ -1.97
SRF1Q12516 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt2.73□□□□□ -1.97
SRF1Q12516 MDS3YGL197W 4464 nt2.73□□□□□ -1.97
SRF1Q12516 SEC7YDR170C 6030 nt2.73□□□□□ -1.97
SRF1Q12516 UFD2YDL190C 2886 nt2.73□□□□□ -1.97
SRF1Q12516 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt2.72□□□□□ -1.97
SRF1Q12516 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt2.71□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 INO80YGL150C 4470 nt2.71□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 MSH5YDL154W 2706 nt2.7□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 COG4YPR105C 2586 nt2.7□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 MOT1YPL082C 5604 nt2.7□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 SRO77YBL106C 3033 nt2.7□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 snR64snR64 101 nt2.7□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 IST2YBR086C 2841 nt2.7□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 RTP1YMR185W 2946 nt2.7□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 ASE1YOR058C 2658 nt2.7□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 CYR1YJL005W 6081 nt2.69□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 ESC1YMR219W 4977 nt2.69□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt2.69□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.69□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 GIP3YPL137C 3831 nt2.69□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 YDL206WYDL206W 2289 nt2.68□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 TOM1YDR457W 9807 nt2.68□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 ORC3YLL004W 1851 nt2.67□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 SXM1YDR395W 2835 nt2.67□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt2.67□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt2.67□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 RAD9YDR217C 3930 nt2.67□□□□□ -1.98
SRF1Q12516 MAK10YEL053C 2202 nt2.66□□□□□ -1.98
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