Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 VAM6YDL077C 3150 nt1.13□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 RAD34YDR314C 2079 nt1.13□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.13□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 YJR011CYJR011C 786 nt1.13□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 PIP2YOR363C 2991 nt1.13□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 RIM20YOR275C 1986 nt1.12□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 RPL34BYIL052C 366 nt1.12□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 HTB2YBL002W 396 nt1.12□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 SWI4YER111C 3282 nt1.12□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 ROM2YLR371W 4071 nt1.11□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 NHP2YDL208W 471 nt1.11□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 YDR048CYDR048C 315 nt1.11□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.11□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 MAM33YIL070C 801 nt1.11□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 YAR029WYAR029W 225 nt1.11□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 IML1YJR138W 4755 nt1.11□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 SPT21YMR179W 2277 nt1.1□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 APL1YJR005W 2103 nt1.1□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 SPO75YLL005C 2607 nt1.1□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 PCC1YKR095W-A 267 nt1.09□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 TAR1YLR154W-C 375 nt1.09□□□□□ -2.23
LDB17Q12342 COG4YPR105C 2586 nt1.09□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 LCD1YDR499W 2244 nt1.09□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 APL3YBL037W 3078 nt1.09□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 AIM44YPL158C 2277 nt1.07□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 SSS1YDR086C 243 nt1.07□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 YER097WYER097W 330 nt1.07□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 YFL032WYFL032W 321 nt1.07□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 YBR206WYBR206W 324 nt1.07□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 NUP145YGL092W 3954 nt1.07□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 SLI15YBR156C 2097 nt1.06□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 YDR344CYDR344C 444 nt1.06□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt1.06□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 snR36snR36 182 nt1.06□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.06□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 SET3YKR029C 2256 nt1.06□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 BUD3YCL014W 4911 nt1.06□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 UBP3YER151C 2739 nt1.05□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 YDR413CYDR413C 576 nt1.05□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 INA22YIR024C 651 nt1.05□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.05□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.05□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 SPT7YBR081C 3999 nt1.05□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 YCK3YER123W 1575 nt1.04□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 STB6YKL072W 2301 nt1.04□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 YJR029WYJR029W 5268 nt1.04□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.04□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 YDR521WYDR521W 336 nt1.04□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 STO1YMR125W 2586 nt1.03□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 FIG4YNL325C 2640 nt1.03□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 EAF1YDR359C 2949 nt1.03□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 ALY2YJL084C 3141 nt1.03□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.03□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 YKL118WYKL118W 312 nt1.03□□□□□ -2.24
LDB17Q12342 DBP6YNR038W 1890 nt1.03□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 YDL206WYDL206W 2289 nt1.03□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 BEM2YER155C 6504 nt1.02□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 YFL063WYFL063W 456 nt1.02□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 OST1YJL002C 1431 nt1.02□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.02□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 IFH1YLR223C 3258 nt1.01□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 PKH2YOL100W 3246 nt1.01□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 YJL120WYJL120W 324 nt1.01□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 YBR064WYBR064W 429 nt1.01□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 HTL1YCR020W-B 237 nt1□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 SPO21YOL091W 1830 nt1□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 DOP1YDR141C 5097 nt0.99□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 KAP120YPL125W 3099 nt0.99□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.99□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.99□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.99□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 YAR009CYAR009C 3591 nt0.99□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 YLL007CYLL007C 1998 nt0.97□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 YKL136WYKL136W 399 nt0.97□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 MMS4YBR098W 2076 nt0.96□□□□□ -2.25
LDB17Q12342 GEA2YEL022W 4380 nt0.96□□□□□ -2.26
LDB17Q12342 COG8YML071C 1824 nt0.96□□□□□ -2.26
LDB17Q12342 SCC2YDR180W 4482 nt0.96□□□□□ -2.26
LDB17Q12342 snR60snR60 104 nt0.96□□□□□ -2.26
LDB17Q12342 RPS25BYLR333C 327 nt0.96□□□□□ -2.26
LDB17Q12342 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt0.96□□□□□ -2.26
LDB17Q12342 MYO1YHR023W 5787 nt0.96□□□□□ -2.26
LDB17Q12342 CUL3YGR003W 2235 nt0.96□□□□□ -2.26
LDB17Q12342 PDE2YOR360C 1581 nt0.96□□□□□ -2.26
LDB17Q12342 STE5YDR103W 2754 nt0.95□□□□□ -2.26
LDB17Q12342 GPG1YGL121C 381 nt0.95□□□□□ -2.26
LDB17Q12342 YIL032CYIL032C 357 nt0.95□□□□□ -2.26
LDB17Q12342 YIR044CYIR044C 186 nt0.95□□□□□ -2.26
LDB17Q12342 YOR015WYOR015W 360 nt0.95□□□□□ -2.26
LDB17Q12342 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.95□□□□□ -2.26
LDB17Q12342 NUP157YER105C 4176 nt0.94□□□□□ -2.26
LDB17Q12342 ALG13YGL047W 609 nt0.94□□□□□ -2.26
LDB17Q12342 YHL042WYHL042W 453 nt0.94□□□□□ -2.26
LDB17Q12342 ECM12YHR021W-A 456 nt0.94□□□□□ -2.26
LDB17Q12342 HUG1YML058W-A 207 nt0.94□□□□□ -2.26
LDB17Q12342 MCM10YIL150C 1716 nt0.93□□□□□ -2.26
LDB17Q12342 STF2YGR008C 255 nt0.93□□□□□ -2.26
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