Protein–RNA interactions for Protein: Q12254

SVS1, Protein SVS1, yeastyeast

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SVS1Q12254 IFH1YLR223C 3258 nt2.27□□□□□ -2.05
SVS1Q12254 MLH3YPL164C 2148 nt2.26□□□□□ -2.05
SVS1Q12254 RPS17AYML024W 411 nt2.26□□□□□ -2.05
SVS1Q12254 SSD1YDR293C 3753 nt2.26□□□□□ -2.05
SVS1Q12254 UTP22YGR090W 3714 nt2.26□□□□□ -2.05
SVS1Q12254 SPF1YEL031W 3648 nt2.25□□□□□ -2.05
SVS1Q12254 REV3YPL167C 4515 nt2.25□□□□□ -2.05
SVS1Q12254 UBP1YDL122W 2430 nt2.25□□□□□ -2.05
SVS1Q12254 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt2.25□□□□□ -2.05
SVS1Q12254 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt2.25□□□□□ -2.05
SVS1Q12254 STH1YIL126W 4080 nt2.25□□□□□ -2.05
SVS1Q12254 YDR521WYDR521W 336 nt2.24□□□□□ -2.05
SVS1Q12254 PBY1YBR094W 2262 nt2.23□□□□□ -2.05
SVS1Q12254 YDR341CYDR341C 1824 nt2.23□□□□□ -2.05
SVS1Q12254 TFC3YAL001C 3483 nt2.22□□□□□ -2.05
SVS1Q12254 TRL1YJL087C 2484 nt2.22□□□□□ -2.05
SVS1Q12254 TIM9YEL020W-A 264 nt2.22□□□□□ -2.05
SVS1Q12254 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt2.22□□□□□ -2.05
SVS1Q12254 ALK1YGL021W 2283 nt2.21□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 SBE22YHR103W 2559 nt2.21□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 SAP185YJL098W 3177 nt2.21□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 CTF4YPR135W 2784 nt2.2□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.2□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 YDR544CYDR544C 429 nt2.2□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 YER053C-AYER053C-A 114 nt2.2□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.2□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 RPS30BYOR182C 192 nt2.2□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 RTT107YHR154W 3213 nt2.2□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 HMI1YOL095C 2121 nt2.2□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 KOG1YHR186C 4674 nt2.2□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 AGC1YPR021C 2709 nt2.19□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 YBR206WYBR206W 324 nt2.19□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 SYH1YPL105C 2550 nt2.19□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 BUD2YKL092C 3315 nt2.19□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 CDC60YPL160W 3273 nt2.18□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 COX12YLR038C 252 nt2.18□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 GIP3YPL137C 3831 nt2.18□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 CTR9YOL145C 3234 nt2.17□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 CSF1YLR087C 8877 nt2.17□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 RAV1YJR033C 4074 nt2.17□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt2.17□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.17□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 TFB5YDR079C-A 219 nt2.16□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 RPL37BYDR500C 267 nt2.16□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.16□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 CHC1YGL206C 4962 nt2.16□□□□□ -2.06
SVS1Q12254 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt2.15□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 PAA1YDR071C 576 nt2.15□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 YMR326CYMR326C 309 nt2.15□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 BRE1YDL074C 2103 nt2.15□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 GYP5YPL249C 2685 nt2.14□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 DNF1YER166W 4716 nt2.14□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.14□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 PKH2YOL100W 3246 nt2.14□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.14□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 COG4YPR105C 2586 nt2.13□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 PET309YLR067C 2898 nt2.13□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 CDC31YOR257W 486 nt2.13□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 YOL098CYOL098C 3114 nt2.13□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 INO80YGL150C 4470 nt2.13□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 TOR2YKL203C 7425 nt2.13□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.13□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 IRC8YJL051W 2469 nt2.12□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 TOF1YNL273W 3717 nt2.12□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.12□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt2.12□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 SLI15YBR156C 2097 nt2.12□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 TTI1YKL033W 3117 nt2.11□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 UFD4YKL010C 4452 nt2.11□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 YNL144CYNL144C 2223 nt2.11□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 YPR097WYPR097W 3222 nt2.11□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 IRE1YHR079C 3348 nt2.1□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 TDA9YML081W 3756 nt2.1□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 RTT101YJL047C 2529 nt2.09□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.09□□□□□ -2.07
SVS1Q12254 HIR3YJR140C 4947 nt2.09□□□□□ -2.08
SVS1Q12254 IST2YBR086C 2841 nt2.09□□□□□ -2.08
SVS1Q12254 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.08□□□□□ -2.08
SVS1Q12254 YBR099CYBR099C 384 nt2.08□□□□□ -2.08
SVS1Q12254 APL1YJR005W 2103 nt2.08□□□□□ -2.08
SVS1Q12254 PRP5YBR237W 2550 nt2.07□□□□□ -2.08
SVS1Q12254 PMP2YEL017C-A 132 nt2.07□□□□□ -2.08
SVS1Q12254 YHR217CYHR217C 462 nt2.07□□□□□ -2.08
SVS1Q12254 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt2.07□□□□□ -2.08
SVS1Q12254 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt2.06□□□□□ -2.08
SVS1Q12254 YOR019WYOR019W 2193 nt2.06□□□□□ -2.08
SVS1Q12254 ADR1YDR216W 3972 nt2.06□□□□□ -2.08
SVS1Q12254 FRK1YPL141C 2598 nt2.05□□□□□ -2.08
SVS1Q12254 TRM3YDL112W 4311 nt2.05□□□□□ -2.08
SVS1Q12254 OST4YDL232W 111 nt2.04□□□□□ -2.08
SVS1Q12254 FKS1YLR342W 5631 nt2.04□□□□□ -2.08
SVS1Q12254 DGR1YNL130C-A 147 nt2.04□□□□□ -2.08
SVS1Q12254 MDS3YGL197W 4464 nt2.04□□□□□ -2.08
SVS1Q12254 FAB1YFR019W 6837 nt2.03□□□□□ -2.08
SVS1Q12254 YDL118WYDL118W 381 nt2.03□□□□□ -2.08
SVS1Q12254 YNL211CYNL211C 261 nt2.03□□□□□ -2.08
SVS1Q12254 YDL206WYDL206W 2289 nt2.03□□□□□ -2.08
SVS1Q12254 YLL054CYLL054C 2532 nt2.02□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.02□□□□□ -2.09
SVS1Q12254 CMC4YMR194C-B 222 nt2.02□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.7 ms