Protein–RNA interactions for Protein: Q12093

SLM3, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3Q12093 PCC1YKR095W-A 267 nt1.1□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 BIL1YOR304C-A 231 nt1.1□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.1□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 RIM20YOR275C 1986 nt1.1□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 NUP188YML103C 4968 nt1.1□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 BUD3YCL014W 4911 nt1.1□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 LCD1YDR499W 2244 nt1.09□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 RPS20YHL015W 366 nt1.09□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 RRT15YLR162W-A 189 nt1.09□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 YPL261CYPL261C 309 nt1.09□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 YPR063CYPR063C 423 nt1.09□□□□□ -2.23
SLM3Q12093 MMS4YBR098W 2076 nt1.09□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 RSM22YKL155C 1887 nt1.08□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 ATG31YDR022C 591 nt1.08□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 YGR035CYGR035C 351 nt1.08□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 YLL020CYLL020C 306 nt1.08□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 RPL38YLR325C 237 nt1.08□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 NST1YNL091W 3723 nt1.07□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 SWI4YER111C 3282 nt1.07□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 CDC36YDL165W 576 nt1.07□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt1.07□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 PKH2YOL100W 3246 nt1.07□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 MSN5YDR335W 3675 nt1.07□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 CUL3YGR003W 2235 nt1.06□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 YLR334CYLR334C 381 nt1.06□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 YPR012WYPR012W 255 nt1.06□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 GPG1YGL121C 381 nt1.05□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 RAD9YDR217C 3930 nt1.05□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 APL3YBL037W 3078 nt1.05□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 SMC1YFL008W 3678 nt1.05□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 RAD34YDR314C 2079 nt1.04□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 GEA2YEL022W 4380 nt1.04□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 RPL34BYIL052C 366 nt1.04□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 YBR012CYBR012C 420 nt1.04□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 MAM33YIL070C 801 nt1.03□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 YIR044CYIR044C 186 nt1.03□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.03□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 STO1YMR125W 2586 nt1.03□□□□□ -2.24
SLM3Q12093 CSN9YDR179C 489 nt1.02□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt1.02□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.02□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 PDE2YOR360C 1581 nt1.02□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.02□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 SET3YKR029C 2256 nt1.01□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 DOP1YDR141C 5097 nt1□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 YDL206WYDL206W 2289 nt1□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 NHP2YDL208W 471 nt1□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 YDR521WYDR521W 336 nt1□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt1□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt1□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt1□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt1□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt1□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt1□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt1□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt1□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt1□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt1□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt1□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 HTB2YBL002W 396 nt1□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 PTP2YOR208W 2253 nt1□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 SLD3YGL113W 2007 nt0.99□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 VAM6YDL077C 3150 nt0.99□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.99□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 CMC4YMR194C-B 222 nt0.99□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 YLL007CYLL007C 1998 nt0.99□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 ALY2YJL084C 3141 nt0.99□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 YJR011CYJR011C 786 nt0.98□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 YAR029WYAR029W 225 nt0.98□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt0.98□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 YPR197CYPR197C 564 nt0.98□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 YJR029WYJR029W 5268 nt0.98□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.98□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 WAR1YML076C 2835 nt0.97□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 IFH1YLR223C 3258 nt0.97□□□□□ -2.25
SLM3Q12093 RPL35AYDL191W 363 nt0.96□□□□□ -2.26
SLM3Q12093 YMR321CYMR321C 318 nt0.96□□□□□ -2.26
SLM3Q12093 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt0.96□□□□□ -2.26
SLM3Q12093 YCS4YLR272C 3531 nt0.95□□□□□ -2.26
SLM3Q12093 NIP100YPL174C 2607 nt0.95□□□□□ -2.26
SLM3Q12093 STB6YKL072W 2301 nt0.94□□□□□ -2.26
SLM3Q12093 BIR1YJR089W 2865 nt0.94□□□□□ -2.26
SLM3Q12093 snR56snR56 88 nt0.94□□□□□ -2.26
SLM3Q12093 HMRA1YCR097W 381 nt0.94□□□□□ -2.26
SLM3Q12093 YDR048CYDR048C 315 nt0.94□□□□□ -2.26
SLM3Q12093 APL1YJR005W 2103 nt0.94□□□□□ -2.26
SLM3Q12093 HMRA2YCR096C 360 nt0.93□□□□□ -2.26
SLM3Q12093 GIM4YEL003W 336 nt0.93□□□□□ -2.26
SLM3Q12093 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt0.93□□□□□ -2.26
SLM3Q12093 PRP16YKR086W 3216 nt0.92□□□□□ -2.26
SLM3Q12093 PAN2YGL094C 3348 nt0.92□□□□□ -2.26
SLM3Q12093 SCC2YDR180W 4482 nt0.91□□□□□ -2.26
SLM3Q12093 ULP2YIL031W 3105 nt0.91□□□□□ -2.26
SLM3Q12093 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.91□□□□□ -2.26
SLM3Q12093 FMP27YLR454W 7887 nt0.9□□□□□ -2.27
SLM3Q12093 TAR1YLR154W-C 375 nt0.89□□□□□ -2.27
SLM3Q12093 CDC39YCR093W 6327 nt0.88□□□□□ -2.27
SLM3Q12093 YAF9YNL107W 681 nt0.87□□□□□ -2.27
SLM3Q12093 YOR218CYOR218C 420 nt0.87□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.1 ms