Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 snR80snR80 171 nt1.29□□□□□ -2.2
YPQ1Q12010 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.29□□□□□ -2.2
YPQ1Q12010 YOR015WYOR015W 360 nt1.29□□□□□ -2.2
YPQ1Q12010 HKR1YDR420W 5409 nt1.29□□□□□ -2.2
YPQ1Q12010 DGR2YKL121W 2559 nt1.29□□□□□ -2.2
YPQ1Q12010 COG8YML071C 1824 nt1.29□□□□□ -2.2
YPQ1Q12010 YJL015CYJL015C 285 nt1.28□□□□□ -2.2
YPQ1Q12010 TRM732YMR259C 4263 nt1.28□□□□□ -2.2
YPQ1Q12010 SCW11YGL028C 1629 nt1.28□□□□□ -2.2
YPQ1Q12010 ZIP1YDR285W 2628 nt1.28□□□□□ -2.2
YPQ1Q12010 YGL041CYGL041C 204 nt1.27□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 SDH2YLL041C 801 nt1.27□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 YOL160WYOL160W 342 nt1.27□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 UFD2YDL190C 2886 nt1.27□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 NUT1YGL151W 3399 nt1.26□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 OST1YJL002C 1431 nt1.26□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 YHL042WYHL042W 453 nt1.26□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.26□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.26□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 SLY1YDR189W 2001 nt1.26□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 PIK1YNL267W 3201 nt1.26□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 ROM2YLR371W 4071 nt1.25□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.25□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 YBR064WYBR064W 429 nt1.25□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 SPT21YMR179W 2277 nt1.25□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 LCD1YDR499W 2244 nt1.24□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 SPO75YLL005C 2607 nt1.24□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 MLH3YPL164C 2148 nt1.24□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 PET127YOR017W 2403 nt1.24□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 PAU2YEL049W 363 nt1.24□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.24□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.24□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 YOR376WYOR376W 369 nt1.24□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 YCK3YER123W 1575 nt1.24□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 PIG1YLR273C 1947 nt1.24□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 VIK1YPL253C 1944 nt1.24□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.24□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 FYV8YGR196C 2454 nt1.23□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 YDL211CYDL211C 1119 nt1.23□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 ZIP2YGL249W 2115 nt1.23□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.23□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 RAD34YDR314C 2079 nt1.23□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 SIP4YJL089W 2490 nt1.23□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.22□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 CSE2YNR010W 450 nt1.22□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 MAD1YGL086W 2250 nt1.22□□□□□ -2.21
YPQ1Q12010 NOC3YLR002C 1992 nt1.21□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.21□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt1.21□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 SEC21YNL287W 2808 nt1.21□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 NPR2YEL062W 1848 nt1.21□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 SAS3YBL052C 2496 nt1.21□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 SPO21YOL091W 1830 nt1.2□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 VPS54YDR027C 2670 nt1.2□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 YGL052WYGL052W 306 nt1.2□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt1.2□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 RPL34BYIL052C 366 nt1.2□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 YJL120WYJL120W 324 nt1.2□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.2□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 RRT15YLR162W-A 189 nt1.2□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 YMR321CYMR321C 318 nt1.2□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 YNL028WYNL028W 318 nt1.2□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 RPL33BYOR234C 324 nt1.2□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 snR49snR49 165 nt1.2□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 AZF1YOR113W 2745 nt1.19□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 ABF2YMR072W 552 nt1.19□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 YAR009CYAR009C 3591 nt1.19□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 NST1YNL091W 3723 nt1.18□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 SWI4YER111C 3282 nt1.18□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 RSM22YKL155C 1887 nt1.18□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 PDE2YOR360C 1581 nt1.17□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 snR74snR74 88 nt1.17□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 YGL217CYGL217C 342 nt1.17□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt1.17□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 snR14snR14 160 nt1.17□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 SMC4YLR086W 4257 nt1.16□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.16□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 IES4YOR189W 351 nt1.16□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 YOR302WYOR302W 78 nt1.16□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 SLX4YLR135W 2247 nt1.16□□□□□ -2.22
YPQ1Q12010 RPS25BYLR333C 327 nt1.15□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.15□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.15□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 YBR206WYBR206W 324 nt1.15□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 SEC3YER008C 4011 nt1.15□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 RAD50YNL250W 3939 nt1.15□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 CDC36YDL165W 576 nt1.14□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 YDR521WYDR521W 336 nt1.14□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 JLP2YMR132C 627 nt1.14□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 RPS30BYOR182C 192 nt1.14□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 PBY1YBR094W 2262 nt1.14□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 ALY2YJL084C 3141 nt1.13□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 YLL054CYLL054C 2532 nt1.13□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 RPS27BYHR021C 249 nt1.13□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 YPR092WYPR092W 306 nt1.13□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 SEC5YDR166C 2916 nt1.13□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 COG4YPR105C 2586 nt1.13□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 SLD3YGL113W 2007 nt1.12□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 snR55snR55 98 nt1.12□□□□□ -2.23
YPQ1Q12010 GPG1YGL121C 381 nt1.12□□□□□ -2.23
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