Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CGNL1Q0VF96 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CGNL1Q0VF96 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CGNL1Q0VF96 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms