Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCDC15Q0P6D6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CCDC15Q0P6D6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms