Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNA1Q09470 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNA1Q09470 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms