Protein–RNA interactions for Protein: Q08962

NIP7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIP7Q08962 YHL042WYHL042W 453 nt0.57□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 YKL083WYKL083W 615 nt0.57□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 YLR101CYLR101C 396 nt0.57□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 YDL073WYDL073W 2955 nt0.57□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 CUL3YGR003W 2235 nt0.56□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 YHL041WYHL041W 450 nt0.56□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 YIR044CYIR044C 186 nt0.56□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 YNL058CYNL058C 951 nt0.56□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 TOM22YNL131W 459 nt0.56□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 YOR282WYOR282W 321 nt0.56□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.56□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 snR41snR41 95 nt0.56□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 INP2YMR163C 2118 nt0.56□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.55□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 YAR047CYAR047C 321 nt0.55□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 YNL303WYNL303W 348 nt0.55□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 PCF11YDR228C 1881 nt0.53□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 YAP6YDR259C 1152 nt0.53□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.53□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 UBC7YMR022W 498 nt0.53□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.53□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.53□□□□□ -2.32
NIP7Q08962 BFR2YDR299W 1605 nt0.53□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.52□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 RPL26AYLR344W 384 nt0.52□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 ECM12YHR021W-A 456 nt0.51□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 YLL007CYLL007C 1998 nt0.51□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 PMP1YCR024C-A 123 nt0.5□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 YDR344CYDR344C 444 nt0.5□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 MAM33YIL070C 801 nt0.5□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 MRPL50YNR022C 420 nt0.5□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 PTP2YOR208W 2253 nt0.49□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 ATG31YDR022C 591 nt0.49□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.49□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.49□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.49□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.49□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.49□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.49□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.49□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.49□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 ISF1YMR081C 1017 nt0.49□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 UTP10YJL109C 5310 nt0.49□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 PRP16YKR086W 3216 nt0.48□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 RPS20YHL015W 366 nt0.48□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 NOP9YJL010C 2001 nt0.48□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 YJR011CYJR011C 786 nt0.47□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 RPL38YLR325C 237 nt0.47□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 ATP19YOL077W-A 207 nt0.47□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 YPL044CYPL044C 549 nt0.47□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 YBR064WYBR064W 429 nt0.47□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 ULP2YIL031W 3105 nt0.47□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 NPR2YEL062W 1848 nt0.47□□□□□ -2.33
NIP7Q08962 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.46□□□□□ -2.34
NIP7Q08962 YCK3YER123W 1575 nt0.45□□□□□ -2.34
NIP7Q08962 CHS6YJL099W 2241 nt0.45□□□□□ -2.34
NIP7Q08962 YML002WYML002W 2214 nt0.45□□□□□ -2.34
NIP7Q08962 NIP100YPL174C 2607 nt0.45□□□□□ -2.34
NIP7Q08962 OLI1Q0130 231 nt0.45□□□□□ -2.34
NIP7Q08962 RPS24BYIL069C 408 nt0.45□□□□□ -2.34
NIP7Q08962 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.45□□□□□ -2.34
NIP7Q08962 LTE1YAL024C 4308 nt0.44□□□□□ -2.34
NIP7Q08962 YOR218CYOR218C 420 nt0.44□□□□□ -2.34
NIP7Q08962 YPL185WYPL185W 396 nt0.44□□□□□ -2.34
NIP7Q08962 YBR206WYBR206W 324 nt0.44□□□□□ -2.34
NIP7Q08962 MCM10YIL150C 1716 nt0.44□□□□□ -2.34
NIP7Q08962 BSC3YLR465C 309 nt0.42□□□□□ -2.34
NIP7Q08962 FMP27YLR454W 7887 nt0.42□□□□□ -2.34
NIP7Q08962 YDR426CYDR426C 378 nt0.41□□□□□ -2.34
NIP7Q08962 YLR456WYLR456W 615 nt0.41□□□□□ -2.34
NIP7Q08962 SPO21YOL091W 1830 nt0.41□□□□□ -2.34
NIP7Q08962 PAA1YDR071C 576 nt0.4□□□□□ -2.35
NIP7Q08962 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.39□□□□□ -2.35
NIP7Q08962 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.38□□□□□ -2.35
NIP7Q08962 PCC1YKR095W-A 267 nt0.38□□□□□ -2.35
NIP7Q08962 RPL26BYGR034W 384 nt0.37□□□□□ -2.35
NIP7Q08962 QCR9YGR183C 201 nt0.36□□□□□ -2.35
NIP7Q08962 YJL007CYJL007C 315 nt0.36□□□□□ -2.35
NIP7Q08962 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.36□□□□□ -2.35
NIP7Q08962 HMRA2YCR096C 360 nt0.35□□□□□ -2.35
NIP7Q08962 YKL063CYKL063C 504 nt0.35□□□□□ -2.35
NIP7Q08962 YOR053WYOR053W 342 nt0.35□□□□□ -2.35
NIP7Q08962 AI1Q0050 2505 nt0.35□□□□□ -2.35
NIP7Q08962 FYV10YIL097W 1551 nt0.34□□□□□ -2.36
NIP7Q08962 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt0.34□□□□□ -2.36
NIP7Q08962 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.34□□□□□ -2.36
NIP7Q08962 YLR434CYLR434C 384 nt0.34□□□□□ -2.36
NIP7Q08962 YNL211CYNL211C 261 nt0.33□□□□□ -2.36
NIP7Q08962 YOL014WYOL014W 375 nt0.33□□□□□ -2.36
NIP7Q08962 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.33□□□□□ -2.36
NIP7Q08962 YPL068CYPL068C 882 nt0.33□□□□□ -2.36
NIP7Q08962 PET111YMR257C 2403 nt0.32□□□□□ -2.36
NIP7Q08962 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.32□□□□□ -2.36
NIP7Q08962 PAU12YGR294W 363 nt0.32□□□□□ -2.36
NIP7Q08962 VPS20YMR077C 666 nt0.32□□□□□ -2.36
NIP7Q08962 ASE1YOR058C 2658 nt0.32□□□□□ -2.36
NIP7Q08962 IQG1YPL242C 4488 nt0.32□□□□□ -2.36
NIP7Q08962 SBH1YER087C-B 249 nt0.31□□□□□ -2.36
NIP7Q08962 SEC8YPR055W 3198 nt0.31□□□□□ -2.36
NIP7Q08962 TRS65YGR166W 1683 nt0.3□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 185.8 ms