Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX4Q06945 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX4Q06945 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms