Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.58□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.58□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.58□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.58□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.58□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.58□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.58□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.58□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.58□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.58□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.58□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 YLR456WYLR456W 615 nt0.58□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 DBP6YNR038W 1890 nt0.58□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 ALG13YGL047W 609 nt0.57□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 PAN2YGL094C 3348 nt0.57□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 BFR2YDR299W 1605 nt0.56□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 LTE1YAL024C 4308 nt0.56□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 YDR344CYDR344C 444 nt0.56□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 RPS20YHL015W 366 nt0.56□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 MAM33YIL070C 801 nt0.56□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 ATG31YDR022C 591 nt0.55□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 ISD11YER048W-A 285 nt0.55□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 YHL042WYHL042W 453 nt0.55□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 YOR029WYOR029W 336 nt0.55□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 MYO1YHR023W 5787 nt0.55□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 CUL3YGR003W 2235 nt0.54□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 YJR011CYJR011C 786 nt0.54□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 YBR064WYBR064W 429 nt0.54□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 YML002WYML002W 2214 nt0.53□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.53□□□□□ -2.32
NEJ1Q06148 NIP100YPL174C 2607 nt0.52□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 YLL007CYLL007C 1998 nt0.52□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 YIR044CYIR044C 186 nt0.52□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 YJL007CYJL007C 315 nt0.52□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 YLR434CYLR434C 384 nt0.52□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.52□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 YPL185WYPL185W 396 nt0.52□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.52□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 YBR206WYBR206W 324 nt0.52□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 YDR426CYDR426C 378 nt0.51□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 STF2YGR008C 255 nt0.51□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 YOR282WYOR282W 321 nt0.51□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 YPL205CYPL205C 345 nt0.51□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 MCM10YIL150C 1716 nt0.5□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 UTP10YJL109C 5310 nt0.5□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.5□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 Q0017Q0017 162 nt0.5□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 YMR160WYMR160W 2451 nt0.49□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 OLI1Q0130 231 nt0.49□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.49□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 NOP9YJL010C 2001 nt0.48□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 OST1YJL002C 1431 nt0.48□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 PMP1YCR024C-A 123 nt0.48□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 ECM12YHR021W-A 456 nt0.48□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 YLR202CYLR202C 327 nt0.48□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 RPL38YLR325C 237 nt0.48□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 YCK3YER123W 1575 nt0.48□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 YKL063CYKL063C 504 nt0.47□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 YPL044CYPL044C 549 nt0.47□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 CHS6YJL099W 2241 nt0.47□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 PTP2YOR208W 2253 nt0.47□□□□□ -2.33
NEJ1Q06148 NPR2YEL062W 1848 nt0.46□□□□□ -2.34
NEJ1Q06148 YJR157WYJR157W 363 nt0.46□□□□□ -2.34
NEJ1Q06148 HUG1YML058W-A 207 nt0.46□□□□□ -2.34
NEJ1Q06148 RPS30BYOR182C 192 nt0.46□□□□□ -2.34
NEJ1Q06148 INA22YIR024C 651 nt0.45□□□□□ -2.34
NEJ1Q06148 PCC1YKR095W-A 267 nt0.45□□□□□ -2.34
NEJ1Q06148 YPL068CYPL068C 882 nt0.45□□□□□ -2.34
NEJ1Q06148 UTP20YBL004W 7482 nt0.44□□□□□ -2.34
NEJ1Q06148 BSC3YLR465C 309 nt0.44□□□□□ -2.34
NEJ1Q06148 PRM3YPL192C 402 nt0.44□□□□□ -2.34
NEJ1Q06148 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.43□□□□□ -2.34
NEJ1Q06148 CSN9YDR179C 489 nt0.42□□□□□ -2.34
NEJ1Q06148 YER079WYER079W 633 nt0.42□□□□□ -2.34
NEJ1Q06148 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.42□□□□□ -2.34
NEJ1Q06148 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.42□□□□□ -2.34
NEJ1Q06148 VPS20YMR077C 666 nt0.42□□□□□ -2.34
NEJ1Q06148 YBR285WYBR285W 435 nt0.42□□□□□ -2.34
NEJ1Q06148 ASE1YOR058C 2658 nt0.41□□□□□ -2.34
NEJ1Q06148 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.41□□□□□ -2.34
NEJ1Q06148 YOR053WYOR053W 342 nt0.41□□□□□ -2.34
NEJ1Q06148 RPL26BYGR034W 384 nt0.4□□□□□ -2.35
NEJ1Q06148 YLR334CYLR334C 381 nt0.4□□□□□ -2.35
NEJ1Q06148 YNL211CYNL211C 261 nt0.4□□□□□ -2.35
NEJ1Q06148 SPO21YOL091W 1830 nt0.39□□□□□ -2.35
NEJ1Q06148 AGA2YGL032C 264 nt0.39□□□□□ -2.35
NEJ1Q06148 YNL324WYNL324W 396 nt0.39□□□□□ -2.35
NEJ1Q06148 HMRA2YCR096C 360 nt0.38□□□□□ -2.35
NEJ1Q06148 PAA1YDR071C 576 nt0.38□□□□□ -2.35
NEJ1Q06148 YOR218CYOR218C 420 nt0.38□□□□□ -2.35
NEJ1Q06148 SGF11YPL047W 300 nt0.38□□□□□ -2.35
NEJ1Q06148 FMP27YLR454W 7887 nt0.38□□□□□ -2.35
NEJ1Q06148 YSP1YHR155W 3687 nt0.38□□□□□ -2.35
NEJ1Q06148 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.37□□□□□ -2.35
NEJ1Q06148 YAR029WYAR029W 225 nt0.37□□□□□ -2.35
NEJ1Q06148 FYV10YIL097W 1551 nt0.36□□□□□ -2.35
NEJ1Q06148 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt0.36□□□□□ -2.35
NEJ1Q06148 YOR121CYOR121C 306 nt0.36□□□□□ -2.35
NEJ1Q06148 YHR138CYHR138C 345 nt0.35□□□□□ -2.35
NEJ1Q06148 TAR1YLR154W-C 375 nt0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.8 ms