Protein–RNA interactions for Protein: Q06147

LCB5, Sphingoid long chain base kinase 5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB5Q06147 RTT107YHR154W 3213 nt2.89□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 NEW1YPL226W 3591 nt2.88□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 YDR210WYDR210W 228 nt2.88□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 SNC1YAL030W 354 nt2.88□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 GEA1YJR031C 4227 nt2.87□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 IKI3YLR384C 4050 nt2.87□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 ESC1YMR219W 4977 nt2.87□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 SVL3YPL032C 2478 nt2.86□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 ILS1YBL076C 3219 nt2.86□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 TAE2YPL009C 3117 nt2.86□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 NFT1YKR103W 3657 nt2.86□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 NOP9YJL010C 2001 nt2.86□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 ATG11YPR049C 3537 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 TAH1YCR060W 336 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 KTI11YBL071W-A 249 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 VMR1YHL035C 4779 nt2.85□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 SGM1YJR134C 2124 nt2.84□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 SAP190YKR028W 3102 nt2.84□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 SAS3YBL052C 2496 nt2.84□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 SPO22YIL073C 2928 nt2.84□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 JSN1YJR091C 3276 nt2.84□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 KAP123YER110C 3342 nt2.84□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 YLR232WYLR232W 348 nt2.84□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt2.84□□□□□ -1.95
LCB5Q06147 NAB6YML117W 3405 nt2.84□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 BUB1YGR188C 3066 nt2.84□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 PHO91YNR013C 2685 nt2.83□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 DNA2YHR164C 4569 nt2.82□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 ALK1YGL021W 2283 nt2.81□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 snR70snR70 164 nt2.81□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.81□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 MLH3YPL164C 2148 nt2.81□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 APL2YKL135C 2181 nt2.81□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 VPS16YPL045W 2397 nt2.81□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 AMS1YGL156W 3252 nt2.81□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 AXL1YPR122W 3627 nt2.81□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 SWR1YDR334W 4545 nt2.81□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 INP51YIL002C 2841 nt2.8□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 ENV11YGR071C 2583 nt2.8□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.8□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 EAF1YDR359C 2949 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 AFI1YOR129C 2682 nt2.79□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 ZRG8YER033C 3231 nt2.78□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 UBP15YMR304W 3693 nt2.78□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 CYR1YJL005W 6081 nt2.78□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt2.78□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.78□□□□□ -1.96
LCB5Q06147 RPL37BYDR500C 267 nt2.77□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt2.77□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 MAK10YEL053C 2202 nt2.77□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 CBF2YGR140W 2871 nt2.77□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 MMS4YBR098W 2076 nt2.77□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 CAF120YNL278W 3183 nt2.76□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 NOP14YDL148C 2433 nt2.76□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 MRD1YPR112C 2664 nt2.76□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 COG4YPR105C 2586 nt2.75□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YKL225WYKL225W 348 nt2.74□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 NUP157YER105C 4176 nt2.74□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 ESL2YKR096W 3588 nt2.74□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YER138CYER138C 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YER160CYER160C 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YJR027WYJR027W 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YML039WYML039W 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YML045WYML045W 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YMR050CYMR050C 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 MDS3YGL197W 4464 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YDR186CYDR186C 2634 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 SLN1YIL147C 3663 nt2.73□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt2.72□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.72□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.72□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.72□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.72□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.72□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.72□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 MGM1YOR211C 2646 nt2.72□□□□□ -1.97
LCB5Q06147 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt2.71□□□□□ -1.98
LCB5Q06147 PDR3YBL005W 2931 nt2.7□□□□□ -1.98
LCB5Q06147 FKS3YMR306W 5358 nt2.69□□□□□ -1.98
LCB5Q06147 IST2YBR086C 2841 nt2.69□□□□□ -1.98
LCB5Q06147 DCP2YNL118C 2913 nt2.69□□□□□ -1.98
LCB5Q06147 BCK1YJL095W 4437 nt2.69□□□□□ -1.98
LCB5Q06147 NUM1YDR150W 8247 nt2.68□□□□□ -1.98
LCB5Q06147 VTC3YPL019C 2508 nt2.68□□□□□ -1.98
LCB5Q06147 TOP2YNL088W 4287 nt2.68□□□□□ -1.98
LCB5Q06147 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt2.68□□□□□ -1.98
LCB5Q06147 SGS1YMR190C 4344 nt2.68□□□□□ -1.98
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