Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRKCZQ05513 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCZQ05513 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.9 ms