Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EMX2Q04743 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EMX2Q04743 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms