Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC34.71■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
ERCC6Q03468 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ERCC6Q03468 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ERCC6Q03468 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms