Protein–RNA interactions for Protein: Q03330

GCN5, Histone acetyltransferase GCN5, yeastyeast

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN5Q03330 YFR016CYFR016C 3702 nt2.3□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 SMC6YLR383W 3345 nt2.29□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 EDS1YBR033W 2760 nt2.29□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 SAS3YBL052C 2496 nt2.29□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 YNL211CYNL211C 261 nt2.29□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 RPS30BYOR182C 192 nt2.29□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 SAP190YKR028W 3102 nt2.29□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 ZIP1YDR285W 2628 nt2.29□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 SBE22YHR103W 2559 nt2.28□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt2.28□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.28□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 OST4YDL232W 111 nt2.28□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 YLR282CYLR282C 342 nt2.28□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 ENV11YGR071C 2583 nt2.28□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 VPS13YLL040C 9435 nt2.28□□□□□ -2.04
GCN5Q03330 ATG11YPR049C 3537 nt2.28□□□□□ -2.05
GCN5Q03330 SVL3YPL032C 2478 nt2.27□□□□□ -2.05
GCN5Q03330 CSF1YLR087C 8877 nt2.27□□□□□ -2.05
GCN5Q03330 DGR2YKL121W 2559 nt2.26□□□□□ -2.05
GCN5Q03330 TRS130YMR218C 3309 nt2.26□□□□□ -2.05
GCN5Q03330 AMS1YGL156W 3252 nt2.25□□□□□ -2.05
GCN5Q03330 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.25□□□□□ -2.05
GCN5Q03330 DCP2YNL118C 2913 nt2.25□□□□□ -2.05
GCN5Q03330 TOF1YNL273W 3717 nt2.25□□□□□ -2.05
GCN5Q03330 DNF1YER166W 4716 nt2.25□□□□□ -2.05
GCN5Q03330 COX12YLR038C 252 nt2.24□□□□□ -2.05
GCN5Q03330 YBR206WYBR206W 324 nt2.24□□□□□ -2.05
GCN5Q03330 APL2YKL135C 2181 nt2.24□□□□□ -2.05
GCN5Q03330 UTP22YGR090W 3714 nt2.24□□□□□ -2.05
GCN5Q03330 TFC3YAL001C 3483 nt2.24□□□□□ -2.05
GCN5Q03330 PTP2YOR208W 2253 nt2.24□□□□□ -2.05
GCN5Q03330 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt2.23□□□□□ -2.05
GCN5Q03330 MMS22YLR320W 4365 nt2.22□□□□□ -2.05
GCN5Q03330 YOR019WYOR019W 2193 nt2.22□□□□□ -2.05
GCN5Q03330 IRC8YJL051W 2469 nt2.22□□□□□ -2.05
GCN5Q03330 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.22□□□□□ -2.05
GCN5Q03330 IFH1YLR223C 3258 nt2.22□□□□□ -2.05
GCN5Q03330 TIM9YEL020W-A 264 nt2.21□□□□□ -2.06
GCN5Q03330 SOM1YEL059C-A 225 nt2.21□□□□□ -2.06
GCN5Q03330 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt2.21□□□□□ -2.06
GCN5Q03330 YDL118WYDL118W 381 nt2.2□□□□□ -2.06
GCN5Q03330 BNI1YNL271C 5862 nt2.2□□□□□ -2.06
GCN5Q03330 UBR1YGR184C 5853 nt2.19□□□□□ -2.06
GCN5Q03330 YNL018CYNL018C 1839 nt2.19□□□□□ -2.06
GCN5Q03330 PRP5YBR237W 2550 nt2.19□□□□□ -2.06
GCN5Q03330 YDR521WYDR521W 336 nt2.19□□□□□ -2.06
GCN5Q03330 ALK1YGL021W 2283 nt2.19□□□□□ -2.06
GCN5Q03330 MAK10YEL053C 2202 nt2.18□□□□□ -2.06
GCN5Q03330 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.18□□□□□ -2.06
GCN5Q03330 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.17□□□□□ -2.06
GCN5Q03330 MLH3YPL164C 2148 nt2.17□□□□□ -2.06
GCN5Q03330 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.16□□□□□ -2.06
GCN5Q03330 CHS6YJL099W 2241 nt2.16□□□□□ -2.06
GCN5Q03330 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.16□□□□□ -2.06
GCN5Q03330 UBP2YOR124C 3819 nt2.16□□□□□ -2.06
GCN5Q03330 YLL054CYLL054C 2532 nt2.16□□□□□ -2.06
GCN5Q03330 KOG1YHR186C 4674 nt2.15□□□□□ -2.06
GCN5Q03330 TTI1YKL033W 3117 nt2.15□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.15□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 REV3YPL167C 4515 nt2.15□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 CHC1YGL206C 4962 nt2.15□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 MSH5YDL154W 2706 nt2.15□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 SEC16YPL085W 6588 nt2.14□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 SSD1YDR293C 3753 nt2.14□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 VPS8YAL002W 3825 nt2.14□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 HMI1YOL095C 2121 nt2.14□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 MET18YIL128W 3099 nt2.13□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 STH1YIL126W 4080 nt2.13□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 GYP5YPL249C 2685 nt2.13□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.12□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 HSL1YKL101W 4557 nt2.12□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 NUP100YKL068W 2880 nt2.12□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 YNL144CYNL144C 2223 nt2.11□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 SAP185YJL098W 3177 nt2.11□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 PKH2YOL100W 3246 nt2.11□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 MDS3YGL197W 4464 nt2.11□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 RGA1YOR127W 3024 nt2.11□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 YGL182CYGL182C 324 nt2.1□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 STF2YGR008C 255 nt2.1□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 INO80YGL150C 4470 nt2.1□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 BRE1YDL074C 2103 nt2.09□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 GIP3YPL137C 3831 nt2.09□□□□□ -2.07
GCN5Q03330 APL1YJR005W 2103 nt2.09□□□□□ -2.08
GCN5Q03330 COG4YPR105C 2586 nt2.08□□□□□ -2.08
GCN5Q03330 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt2.08□□□□□ -2.08
GCN5Q03330 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.08□□□□□ -2.08
GCN5Q03330 LHS1YKL073W 2646 nt2.08□□□□□ -2.08
GCN5Q03330 AGC1YPR021C 2709 nt2.08□□□□□ -2.08
GCN5Q03330 USO1YDL058W 5373 nt2.07□□□□□ -2.08
GCN5Q03330 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt2.07□□□□□ -2.08
GCN5Q03330 BUD2YKL092C 3315 nt2.06□□□□□ -2.08
GCN5Q03330 RAV1YJR033C 4074 nt2.06□□□□□ -2.08
GCN5Q03330 QCR9YGR183C 201 nt2.06□□□□□ -2.08
GCN5Q03330 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.06□□□□□ -2.08
GCN5Q03330 UFD4YKL010C 4452 nt2.06□□□□□ -2.08
GCN5Q03330 TOR2YKL203C 7425 nt2.06□□□□□ -2.08
GCN5Q03330 SLI15YBR156C 2097 nt2.05□□□□□ -2.08
GCN5Q03330 STB6YKL072W 2301 nt2.05□□□□□ -2.08
GCN5Q03330 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.04□□□□□ -2.08
GCN5Q03330 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56.9 ms