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Protein–RNA interactions for Protein: Q03071
ELC1, Elongin-C, yeast
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99 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
ELC1
Q03071
snR45
snR45
172 nt
-0.32
□□□□□ -2.46
ELC1
Q03071
MAM33
YIL070C
801 nt
-0.33
□□□□□ -2.46
ELC1
Q03071
YIR021W-A
YIR021W-A
213 nt
-0.33
□□□□□ -2.46
ELC1
Q03071
PBI2
YNL015W
228 nt
-0.33
□□□□□ -2.46
ELC1
Q03071
YIR044C
YIR044C
186 nt
-0.34
□□□□□ -2.46
ELC1
Q03071
APQ13
YJL075C
417 nt
-0.34
□□□□□ -2.46
ELC1
Q03071
YNL146W
YNL146W
303 nt
-0.34
□□□□□ -2.46
ELC1
Q03071
SPO21
YOL091W
1830 nt
-0.35
□□□□□ -2.47
ELC1
Q03071
snR72
snR72
98 nt
-0.35
□□□□□ -2.47
ELC1
Q03071
SCEI
Q0160
708 nt
-0.35
□□□□□ -2.47
ELC1
Q03071
YLR399W-A
YLR399W-A
105 nt
-0.35
□□□□□ -2.47
ELC1
Q03071
YMR254C
YMR254C
309 nt
-0.35
□□□□□ -2.47
ELC1
Q03071
SNU56
YDR240C
1479 nt
-0.35
□□□□□ -2.47
ELC1
Q03071
EMC4
YGL231C
573 nt
-0.36
□□□□□ -2.47
ELC1
Q03071
YBR206W
YBR206W
324 nt
-0.36
□□□□□ -2.47
ELC1
Q03071
YER135C
YER135C
393 nt
-0.37
□□□□□ -2.47
ELC1
Q03071
YKL202W
YKL202W
582 nt
-0.37
□□□□□ -2.47
ELC1
Q03071
NNF2
YGR089W
2811 nt
-0.38
□□□□□ -2.47
ELC1
Q03071
THO2
YNL139C
4794 nt
-0.38
□□□□□ -2.47
ELC1
Q03071
ECM9
YKR004C
1134 nt
-0.38
□□□□□ -2.47
ELC1
Q03071
YNL211C
YNL211C
261 nt
-0.38
□□□□□ -2.47
ELC1
Q03071
YOR345C
YOR345C
351 nt
-0.38
□□□□□ -2.47
ELC1
Q03071
YML108W
YML108W
318 nt
-0.39
□□□□□ -2.47
ELC1
Q03071
DCP1
YOL149W
696 nt
-0.39
□□□□□ -2.47
ELC1
Q03071
SOV1
YMR066W
2697 nt
-0.39
□□□□□ -2.47
ELC1
Q03071
YDL187C
YDL187C
330 nt
-0.4
□□□□□ -2.47
ELC1
Q03071
MND1
YGL183C
660 nt
-0.4
□□□□□ -2.47
ELC1
Q03071
YGL230C
YGL230C
444 nt
-0.4
□□□□□ -2.47
ELC1
Q03071
YIL066W-A
YIL066W-A
444 nt
-0.4
□□□□□ -2.47
ELC1
Q03071
YER078W-A
YER078W-A
165 nt
-0.41
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
HUR1
YGL168W
333 nt
-0.41
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
YKU70
YMR284W
1809 nt
-0.42
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
snR8
snR8
190 nt
-0.42
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
YDR210W
YDR210W
228 nt
-0.42
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
YOL029C
YOL029C
606 nt
-0.42
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
UBS1
YBR165W
834 nt
-0.42
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
NIP1
YMR309C
2439 nt
-0.43
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
COY1
YKL179C
2040 nt
-0.43
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
YHL046W-A
YHL046W-A
327 nt
-0.43
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
YKL023C-A
YKL023C-A
228 nt
-0.43
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
PTP2
YOR208W
2253 nt
-0.43
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
YKL136W
YKL136W
399 nt
-0.44
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
snR51
snR51
107 nt
-0.44
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
YER175W-A
YER175W-A
165 nt
-0.45
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
YJR011C
YJR011C
786 nt
-0.45
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
YLR171W
YLR171W
390 nt
-0.45
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
IPP1
YBR011C
864 nt
-0.45
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
tF(GAA)B
tF(GAA)B
73 nt
-0.46
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
tF(GAA)F
tF(GAA)F
73 nt
-0.46
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
tF(GAA)G
tF(GAA)G
73 nt
-0.46
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
tF(GAA)H1
tF(GAA)H1
73 nt
-0.46
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
tF(GAA)H2
tF(GAA)H2
73 nt
-0.46
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
tF(GAA)M
tF(GAA)M
73 nt
-0.46
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
tF(GAA)P1
tF(GAA)P1
73 nt
-0.46
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
tF(GAA)P2
tF(GAA)P2
73 nt
-0.46
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
SLX9
YGR081C
633 nt
-0.46
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
snR128
snR128
126 nt
-0.46
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
YPL182C
YPL182C
384 nt
-0.46
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
YGR025W
YGR025W
303 nt
-0.47
□□□□□ -2.48
ELC1
Q03071
YAR053W
YAR053W
297 nt
-0.48
□□□□□ -2.49
ELC1
Q03071
tN(GUU)Q
tN(GUU)Q
71 nt
-0.49
□□□□□ -2.49
ELC1
Q03071
RPS20
YHL015W
366 nt
-0.49
□□□□□ -2.49
ELC1
Q03071
YCR001W
YCR001W
315 nt
-0.5
□□□□□ -2.49
ELC1
Q03071
SBH2
YER019C-A
267 nt
-0.5
□□□□□ -2.49
ELC1
Q03071
TIM13
YGR181W
318 nt
-0.5
□□□□□ -2.49
ELC1
Q03071
YJR087W
YJR087W
351 nt
-0.5
□□□□□ -2.49
ELC1
Q03071
SDH7
YDR511W
402 nt
-0.51
□□□□□ -2.49
ELC1
Q03071
YJR141W
YJR141W
1044 nt
-0.51
□□□□□ -2.49
ELC1
Q03071
YIL029C
YIL029C
429 nt
-0.53
□□□□□ -2.49
ELC1
Q03071
YEL073C
YEL073C
324 nt
-0.54
□□□□□ -2.5
ELC1
Q03071
YHR131W-A
YHR131W-A
246 nt
-0.54
□□□□□ -2.5
ELC1
Q03071
ATG31
YDR022C
591 nt
-0.55
□□□□□ -2.5
ELC1
Q03071
YKL044W
YKL044W
321 nt
-0.55
□□□□□ -2.5
ELC1
Q03071
YOL014W
YOL014W
375 nt
-0.55
□□□□□ -2.5
ELC1
Q03071
TSC3
YBR058C-A
243 nt
-0.55
□□□□□ -2.5
ELC1
Q03071
BUL2
YML111W
2763 nt
-0.55
□□□□□ -2.5
ELC1
Q03071
YDL185C-A
YDL185C-A
228 nt
-0.56
□□□□□ -2.5
ELC1
Q03071
NIP100
YPL174C
2607 nt
-0.56
□□□□□ -2.5
ELC1
Q03071
RAD61
YDR014W
1944 nt
-0.58
□□□□□ -2.5
ELC1
Q03071
RPF1
YHR088W
888 nt
-0.58
□□□□□ -2.5
ELC1
Q03071
YLL006W-A
YLL006W-A
177 nt
-0.58
□□□□□ -2.5
ELC1
Q03071
SEM1
YDR363W-A
270 nt
-0.59
□□□□□ -2.5
ELC1
Q03071
YLR101C
YLR101C
396 nt
-0.59
□□□□□ -2.5
ELC1
Q03071
YMR307C-A
YMR307C-A
195 nt
-0.59
□□□□□ -2.5
ELC1
Q03071
YOR011W-A
YOR011W-A
207 nt
-0.59
□□□□□ -2.5
ELC1
Q03071
MRPS8
YMR158W
468 nt
-0.6
□□□□□ -2.51
ELC1
Q03071
YCR018C-A
YCR018C-A
255 nt
-0.61
□□□□□ -2.51
ELC1
Q03071
TFB5
YDR079C-A
219 nt
-0.61
□□□□□ -2.51
ELC1
Q03071
HMLALPHA2
YCL067C
633 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
ELC1
Q03071
MATALPHA2
YCR039C
633 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
ELC1
Q03071
STF2
YGR008C
255 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
ELC1
Q03071
YNL058C
YNL058C
951 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
ELC1
Q03071
YNL319W
YNL319W
441 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
ELC1
Q03071
SGF11
YPL047W
300 nt
-0.62
□□□□□ -2.51
ELC1
Q03071
YCR100C
YCR100C
951 nt
-0.63
□□□□□ -2.51
ELC1
Q03071
YHL041W
YHL041W
450 nt
-0.63
□□□□□ -2.51
ELC1
Q03071
HTB2
YBL002W
396 nt
-0.63
□□□□□ -2.51
ELC1
Q03071
BER1
YLR412W
825 nt
-0.63
□□□□□ -2.51
ELC1
Q03071
SVS1
YPL163C
783 nt
-0.63
□□□□□ -2.51
ELC1
Q03071
YJL020W-A
YJL020W-A
258 nt
-0.64
□□□□□ -2.51
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