Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
PLOD1Q02809 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PLOD1Q02809 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms