Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPIBQ01892 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPIBQ01892 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SPIBQ01892 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPIBQ01892 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPIBQ01892 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPIBQ01892 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPIBQ01892 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms