Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM4P67936 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM4P67936 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM4P67936 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM4P67936 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM4P67936 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TPM4P67936 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TPM4P67936 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM4P67936 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM4P67936 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM4P67936 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM4P67936 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM4P67936 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM4P67936 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM4P67936 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM4P67936 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM4P67936 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM4P67936 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM4P67936 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM4P67936 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM4P67936 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM4P67936 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM4P67936 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TPM4P67936 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TPM4P67936 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TPM4P67936 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPM4P67936 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TPM4P67936 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPM4P67936 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPM4P67936 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM4P67936 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPM4P67936 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms