Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ACTG1P63261 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTG1P63261 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms