Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR2LP62875 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms