Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPEP62304 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPEP62304 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms