Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VBP1P61758 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VBP1P61758 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VBP1P61758 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VBP1P61758 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VBP1P61758 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VBP1P61758 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VBP1P61758 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VBP1P61758 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VBP1P61758 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VBP1P61758 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VBP1P61758 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VBP1P61758 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VBP1P61758 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VBP1P61758 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VBP1P61758 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VBP1P61758 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VBP1P61758 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VBP1P61758 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VBP1P61758 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VBP1P61758 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VBP1P61758 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VBP1P61758 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VBP1P61758 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VBP1P61758 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VBP1P61758 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VBP1P61758 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VBP1P61758 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VBP1P61758 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VBP1P61758 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VBP1P61758 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VBP1P61758 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VBP1P61758 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VBP1P61758 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VBP1P61758 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
VBP1P61758 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VBP1P61758 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VBP1P61758 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VBP1P61758 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VBP1P61758 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VBP1P61758 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VBP1P61758 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VBP1P61758 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VBP1P61758 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VBP1P61758 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VBP1P61758 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VBP1P61758 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VBP1P61758 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VBP1P61758 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VBP1P61758 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VBP1P61758 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VBP1P61758 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms