Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLF3P57682 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLF3P57682 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLF3P57682 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLF3P57682 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLF3P57682 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KLF3P57682 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KLF3P57682 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF3P57682 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF3P57682 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF3P57682 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF3P57682 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF3P57682 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF3P57682 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF3P57682 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF3P57682 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF3P57682 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF3P57682 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF3P57682 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF3P57682 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KLF3P57682 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms