Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP9P55211 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP9P55211 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP9P55211 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP9P55211 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP9P55211 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP9P55211 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP9P55211 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP9P55211 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP9P55211 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP9P55211 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP9P55211 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP9P55211 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CASP9P55211 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP9P55211 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP9P55211 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP9P55211 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP9P55211 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP9P55211 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP9P55211 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP9P55211 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP9P55211 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP9P55211 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP9P55211 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP9P55211 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP9P55211 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP9P55211 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP9P55211 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP9P55211 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP9P55211 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP9P55211 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP9P55211 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CASP9P55211 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CASP9P55211 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP9P55211 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP9P55211 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP9P55211 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP9P55211 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP9P55211 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP9P55211 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP9P55211 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP9P55211 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP9P55211 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP9P55211 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP9P55211 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP9P55211 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP9P55211 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP9P55211 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP9P55211 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP9P55211 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP9P55211 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP9P55211 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP9P55211 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP9P55211 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CASP9P55211 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP9P55211 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP9P55211 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP9P55211 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP9P55211 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP9P55211 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP9P55211 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP9P55211 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP9P55211 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP9P55211 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP9P55211 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP9P55211 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP9P55211 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP9P55211 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP9P55211 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms