Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCKAP1LP55160 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms