Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LBX1P52954 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LBX1P52954 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LBX1P52954 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LBX1P52954 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LBX1P52954 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LBX1P52954 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LBX1P52954 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LBX1P52954 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LBX1P52954 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LBX1P52954 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LBX1P52954 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LBX1P52954 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LBX1P52954 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LBX1P52954 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LBX1P52954 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LBX1P52954 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LBX1P52954 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LBX1P52954 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LBX1P52954 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LBX1P52954 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LBX1P52954 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LBX1P52954 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LBX1P52954 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LBX1P52954 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LBX1P52954 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LBX1P52954 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LBX1P52954 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LBX1P52954 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LBX1P52954 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LBX1P52954 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LBX1P52954 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LBX1P52954 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LBX1P52954 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LBX1P52954 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LBX1P52954 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LBX1P52954 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LBX1P52954 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LBX1P52954 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LBX1P52954 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBX1P52954 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBX1P52954 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBX1P52954 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBX1P52954 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBX1P52954 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBX1P52954 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBX1P52954 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBX1P52954 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBX1P52954 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBX1P52954 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBX1P52954 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBX1P52954 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LBX1P52954 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBX1P52954 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LBX1P52954 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBX1P52954 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBX1P52954 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LBX1P52954 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LBX1P52954 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBX1P52954 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBX1P52954 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBX1P52954 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBX1P52954 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBX1P52954 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBX1P52954 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBX1P52954 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBX1P52954 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBX1P52954 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBX1P52954 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBX1P52954 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBX1P52954 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBX1P52954 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBX1P52954 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBX1P52954 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBX1P52954 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBX1P52954 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBX1P52954 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LBX1P52954 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBX1P52954 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBX1P52954 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBX1P52954 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBX1P52954 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBX1P52954 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBX1P52954 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LBX1P52954 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBX1P52954 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBX1P52954 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBX1P52954 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBX1P52954 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBX1P52954 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBX1P52954 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBX1P52954 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LBX1P52954 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LBX1P52954 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBX1P52954 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBX1P52954 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBX1P52954 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LBX1P52954 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LBX1P52954 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LBX1P52954 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms