Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGDP52209 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGDP52209 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGDP52209 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGDP52209 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGDP52209 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGDP52209 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGDP52209 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGDP52209 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGDP52209 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGDP52209 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGDP52209 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGDP52209 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGDP52209 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGDP52209 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGDP52209 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGDP52209 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGDP52209 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGDP52209 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PGDP52209 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PGDP52209 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PGDP52209 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGDP52209 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGDP52209 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGDP52209 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGDP52209 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGDP52209 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGDP52209 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGDP52209 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGDP52209 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGDP52209 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGDP52209 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGDP52209 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGDP52209 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGDP52209 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGDP52209 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGDP52209 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PGDP52209 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGDP52209 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PGDP52209 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGDP52209 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGDP52209 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGDP52209 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGDP52209 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGDP52209 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGDP52209 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGDP52209 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PGDP52209 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms