Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLCN3P51790 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms