Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSN1S1P47710 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms