Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNNT3P45378 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms