Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF9P41273 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNFSF9P41273 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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