Protein–RNA interactions for Protein: P38202

YBL028C, UPF0642 protein YBL028C, yeastyeast

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL028CP38202 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt1.07□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 YNL058CYNL058C 951 nt1.07□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.07□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 FIG4YNL325C 2640 nt1.07□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 IFH1YLR223C 3258 nt1.07□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.06□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.06□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.06□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 YCK3YER123W 1575 nt1.05□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 PDE2YOR360C 1581 nt1.05□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 MMS4YBR098W 2076 nt1.05□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.05□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.05□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.05□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.05□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.05□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt1.05□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 VAM6YDL077C 3150 nt1.05□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 BUD3YCL014W 4911 nt1.04□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 YDL073WYDL073W 2955 nt1.04□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.04□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt1.04□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 PAN2YGL094C 3348 nt1.03□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 IRC23YOR044W 474 nt1.03□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.03□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 PRP16YKR086W 3216 nt1.03□□□□□ -2.24
YBL028CP38202 YDL206WYDL206W 2289 nt1.03□□□□□ -2.25
YBL028CP38202 BEM2YER155C 6504 nt1.02□□□□□ -2.25
YBL028CP38202 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1.02□□□□□ -2.25
YBL028CP38202 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.02□□□□□ -2.25
YBL028CP38202 YOR121CYOR121C 306 nt1.02□□□□□ -2.25
YBL028CP38202 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.02□□□□□ -2.25
YBL028CP38202 KAP120YPL125W 3099 nt1.02□□□□□ -2.25
YBL028CP38202 UBP3YER151C 2739 nt1.02□□□□□ -2.25
YBL028CP38202 AIM44YPL158C 2277 nt1.01□□□□□ -2.25
YBL028CP38202 CSN9YDR179C 489 nt1.01□□□□□ -2.25
YBL028CP38202 RPL34BYIL052C 366 nt1.01□□□□□ -2.25
YBL028CP38202 MAM33YIL070C 801 nt1.01□□□□□ -2.25
YBL028CP38202 YJR011CYJR011C 786 nt1.01□□□□□ -2.25
YBL028CP38202 YDR426CYDR426C 378 nt1□□□□□ -2.25
YBL028CP38202 YHL042WYHL042W 453 nt1□□□□□ -2.25
YBL028CP38202 YDR521WYDR521W 336 nt0.98□□□□□ -2.25
YBL028CP38202 GPG1YGL121C 381 nt0.98□□□□□ -2.25
YBL028CP38202 PKH2YOL100W 3246 nt0.98□□□□□ -2.25
YBL028CP38202 UTP20YBL004W 7482 nt0.97□□□□□ -2.25
YBL028CP38202 YIR044CYIR044C 186 nt0.97□□□□□ -2.25
YBL028CP38202 RIM20YOR275C 1986 nt0.96□□□□□ -2.26
YBL028CP38202 YDL196WYDL196W 330 nt0.96□□□□□ -2.26
YBL028CP38202 YOL014WYOL014W 375 nt0.96□□□□□ -2.26
YBL028CP38202 YBR206WYBR206W 324 nt0.96□□□□□ -2.26
YBL028CP38202 WAR1YML076C 2835 nt0.95□□□□□ -2.26
YBL028CP38202 YJR029WYJR029W 5268 nt0.95□□□□□ -2.26
YBL028CP38202 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.95□□□□□ -2.26
YBL028CP38202 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt0.94□□□□□ -2.26
YBL028CP38202 YBR064WYBR064W 429 nt0.94□□□□□ -2.26
YBL028CP38202 SMC1YFL008W 3678 nt0.94□□□□□ -2.26
YBL028CP38202 YMR160WYMR160W 2451 nt0.93□□□□□ -2.26
YBL028CP38202 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.93□□□□□ -2.26
YBL028CP38202 PCC1YKR095W-A 267 nt0.93□□□□□ -2.26
YBL028CP38202 YLL007CYLL007C 1998 nt0.92□□□□□ -2.26
YBL028CP38202 CUL3YGR003W 2235 nt0.91□□□□□ -2.26
YBL028CP38202 YDR157WYDR157W 402 nt0.91□□□□□ -2.26
YBL028CP38202 RKR1YMR247C 4689 nt0.91□□□□□ -2.26
YBL028CP38202 YAR053WYAR053W 297 nt0.9□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 RPL35AYDL191W 363 nt0.88□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 YFL019CYFL019C 354 nt0.88□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 YGR035CYGR035C 351 nt0.88□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.88□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 YLR334CYLR334C 381 nt0.88□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 GEA2YEL022W 4380 nt0.87□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 YPR117WYPR117W 7470 nt0.87□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 ALG13YGL047W 609 nt0.87□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 ASE1YOR058C 2658 nt0.86□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 NHP2YDL208W 471 nt0.86□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 BFR2YDR299W 1605 nt0.86□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 SCC2YDR180W 4482 nt0.85□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 PTP2YOR208W 2253 nt0.85□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 MCM10YIL150C 1716 nt0.85□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 YJL120WYJL120W 324 nt0.85□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 ISD11YER048W-A 285 nt0.84□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.84□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.84□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.84□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.84□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.84□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.84□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.84□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.84□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 YAR029WYAR029W 225 nt0.84□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 CMC4YMR194C-B 222 nt0.84□□□□□ -2.27
YBL028CP38202 DOP1YDR141C 5097 nt0.83□□□□□ -2.28
YBL028CP38202 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt0.83□□□□□ -2.28
YBL028CP38202 SEC1YDR164C 2175 nt0.82□□□□□ -2.28
YBL028CP38202 PMP1YCR024C-A 123 nt0.82□□□□□ -2.28
YBL028CP38202 NOP9YJL010C 2001 nt0.82□□□□□ -2.28
YBL028CP38202 YDR344CYDR344C 444 nt0.81□□□□□ -2.28
YBL028CP38202 OLI1Q0130 231 nt0.81□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 167.8 ms