Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LTBRP36941 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBRP36941 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBRP36941 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBRP36941 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBRP36941 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBRP36941 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBRP36941 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBRP36941 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBRP36941 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBRP36941 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBRP36941 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBRP36941 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBRP36941 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBRP36941 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBRP36941 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBRP36941 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBRP36941 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LTBRP36941 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBRP36941 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBRP36941 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBRP36941 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBRP36941 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBRP36941 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBRP36941 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBRP36941 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBRP36941 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBRP36941 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBRP36941 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBRP36941 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBRP36941 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBRP36941 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBRP36941 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBRP36941 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
LTBRP36941 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBRP36941 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBRP36941 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBRP36941 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBRP36941 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBRP36941 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBRP36941 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBRP36941 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBRP36941 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBRP36941 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBRP36941 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBRP36941 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBRP36941 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBRP36941 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBRP36941 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBRP36941 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBRP36941 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBRP36941 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBRP36941 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBRP36941 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBRP36941 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBRP36941 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LTBRP36941 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LTBRP36941 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
LTBRP36941 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LTBRP36941 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LTBRP36941 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
LTBRP36941 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LTBRP36941 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LTBRP36941 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LTBRP36941 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LTBRP36941 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBRP36941 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBRP36941 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBRP36941 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBRP36941 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBRP36941 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBRP36941 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBRP36941 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBRP36941 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBRP36941 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBRP36941 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBRP36941 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBRP36941 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBRP36941 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBRP36941 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBRP36941 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBRP36941 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LTBRP36941 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBRP36941 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBRP36941 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBRP36941 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBRP36941 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBRP36941 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBRP36941 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LTBRP36941 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms