Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKARP32238 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKARP32238 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKARP32238 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKARP32238 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKARP32238 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKARP32238 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKARP32238 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKARP32238 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKARP32238 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKARP32238 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKARP32238 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKARP32238 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKARP32238 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKARP32238 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKARP32238 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKARP32238 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKARP32238 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKARP32238 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKARP32238 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKARP32238 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKARP32238 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKARP32238 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKARP32238 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKARP32238 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKARP32238 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKARP32238 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKARP32238 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKARP32238 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKARP32238 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKARP32238 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKARP32238 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKARP32238 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKARP32238 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKARP32238 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKARP32238 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKARP32238 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKARP32238 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKARP32238 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKARP32238 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKARP32238 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCKARP32238 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCKARP32238 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCKARP32238 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCKARP32238 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCKARP32238 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCKARP32238 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCKARP32238 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCKARP32238 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKARP32238 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms