Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA7P31268 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA7P31268 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms